ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอและกิ่งอำเภอ จัดตั้งขึ้นตามประกาศกระทรวงศึกษาธิการ
เรื่อง การจัดตั้งศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอและกิ่งอำเภอ ลงวันที่ 27 สิงหาคม 2536 พร้อมกัน
ทั่วประเทศ จำนวน ๗๘๙ แห่ง ( ลงนามโดย นายปราโมทย์ สุขุม รัฐมนตรีช่วยว่าการ ฯ รักษาราชการแทนรัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ ) ( อ้างจากหนังสือกรมการศึกษานอกโรงเรียนที่ 1103/1897 ลงวันที่ 6 กันยายน 2536 ) ใช้ชื่อว่า “ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอรัตนบุรี” มีสถานะเป็นสถานศึกษา สังกัดศูนย์การศึกษานอกโรงเรียนจังหวัดสุรินทร์ กรมการศึกษานอกโรงเรียนกระทรวงศึกษาธิการ สถานที่ตั้งครั้งแรก ใช้อาคารของห้องสมุดประชาชนอำเภอรัตนบุรีเป็นสถานที่ตั้ง เนื่องจากไม่มีงบประมาณสนับสนุนการก่อสร้างอาคาร จึงได้ต่อเติมอาคารห้องสมุดประชาชนใช้เป็นอาคารสำนักงาน
ต่อมาในปี พ.ศ. 2547 กรมการศึกษานอกโรงเรียน ซึ่งเป็นหน่วยงานต้นสังกัด ได้ปรับบทบาทสังกัด เพื่อให้สอดรับกับ พระราชบัญญัติการศึกษาแห่งชาติ พุทธศักราช 2542 ชื่อใหม่เป็น “สำนักบริหารงานการศึกษานอกโรงเรียน” สังกัดสำนักปลัดกระทรวงศึกษาธิการกระทรวงศึกษาธิการ จึงทำให้ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอ
รัตนบุรี เปลี่ยนสังกัดเป็น สังกัดศูนย์การศึกษานอกโรงเรียนจังหวัดสุรินทร์ สำนักบริหารงานการศึกษานอกโรงเรียนสำนักงานปลัดกระทรวงศึกษาธิการ กระทรวงศึกษาธิการ และจากการที่ใช้อาคารร่วมกับห้องสมุดประชาชนอำเภอรัตนบุรี เป็นสำนักงานในการทำงาน นั้น การจัดกิจกรรมการศึกษานอกโรงเรียน ไม่สามารถให้บริการผู้เรียน/ ผู้รับบริการ ได้อย่างเต็มที่มากนัก เนื่องจากอาคารสถานที่คับแคบ จึงได้ขอใช้อาคารที่ทำการอำเภอรัตนบุรี (หลังเก่า) ใช้เป็นที่ตั้งเพื่อบริการกลุ่มเป้าหมาย และทางอำเภอได้อนุญาตให้ใช้เป็นที่ตั้งของสำนักงานจนกระทั่ง ปี 2548 เพื่อให้การบริการกลุ่มเป้าหมาย และให้การปฏิบัติงานได้รับความสะดวกมากขึ้น นายสมพงษ์ สมทิพย์ ผู้อำนวยการสถานศึกษา (ในขณะนั้น) จึงได้ขอใช้อาคารสำนักงานการประถมศึกษาอำเภอรัตนบุรี จากสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาสุรินทร์ เขต 2 เพื่อใช้เป็นที่ตั้งใน
การปฏิบัติงานของสถานศึกษา โดย นายสิงห์ทอง สิงห์พรพรพงศ์ ผู้อำนวยการสำนักงานพื้นที่การศึกษาสุรินทร์ เขต 2
(ในขณะนั้น) ได้เห็นความจำเป็นและความสำคัญของงานการศึกษานอกโรงเรียนที่จะต้องให้บริการกลุ่มเป้าหมาย
ผู้พลาดโอกาส ผู้ด้อยโอกาส รวมถึงหน่วยงานราชการ ให้ได้รับความสะดวกในการติดต่อประสานงาน จึงได้อนุญาตให้ใช้อาคารสำนักงานการประถมศึกษาอำเภอรัตนบุรี
ต่อมา พระราชบัญญัติส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยพุทธศักราช 2551 ได้ประกาศใช้ ในราชกิจจานุเบกษา เมื่อวันที่ 3 มีนาคม พ.ศ. 2551 หน้า 1 เล่ม 125 ตอนที่ 41 จึงทำให้ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอรัตนบุรี เปลี่ยนชื่อเป็น “ศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยอำเภอรัตนบุรี” ชื่อย่อ “ กศน.อำเภอรัตนบุรี” และได้ปรับบทบาท ภารกิจหน้าที่ใหม่อีกครั้งหนึ่ง จนมาถึงปัจจุบัน